R语言 DEDS包 comp.modF()函数中文帮助文档(中英文对照)

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comp.modF(DEDS)
comp.modF()所属R语言包：DEDS

                                        Computing Moderated t-statistics for Differential Expression
                                         计算主持差异表达的t-统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

comp.modF returns a function of one argument with bindings for L. The function accepts a microarray data matrix as its single argument, when evaluated, computes moderated F-statistics by empirical Bayes shrinkage of the standard error toward a common value.
comp.modF返回一个参数的函数绑定L。该函数接受作为其单个参数的微阵列数据矩阵，计算时，计算F-统计主持经验Bayes朝着一个共同的价值标准错误的收缩。


用法----------Usage----------


comp.modF(L = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：L
A vector of integers corresponding to observation (column) class labels. For k classes, the labels must be integers between 0 and k-1.
观察（列）类的标签对应的整数向量。对于k类，标签必须是0k-1之间的整数。


Details

详情----------Details----------

The function returned by comp.modF computes moderated F statistics for the assessment of differential expression. It interfaces to a C function. comp.stat is another function that wraps around the C function that could be used for computing moderated F statistics. For details of moderated statistics, see Smyth (2003).
该函数返回comp.modF计算缓和，F统计量的差异表达进行评估。一个C函数接口。 comp.stat包裹周围的C函数，可以使用F统计量计算放缓的另一个功能。放缓统计的详细信息，请参阅史密斯（2003年）。


值----------Value----------

comp.modF returns a function (F) with the bindings for L. The function F when supplied with a microarray data matrix and evaluated will return a numeric vector of moderated F statistics for each row of the matrix.
comp.modF（F）与绑定L返回一个函数。提供微阵列数据矩阵和评价函数F将返回一个放缓的F统计量的数字向量，矩阵的每一行。


作者（S）----------Author(s)----------



Yuanyuan Xiao, <a href="mailto:yxiao@itsa.ucsf.edu">yxiao@itsa.ucsf.edu</a>, <br>
Jean Yee Hwa Yang, <a href="mailto:jean@biostat.ucsf.edu">jean@biostat.ucsf.edu</a>.




参考文献----------References----------

data. Statistica Sinica 12, 31-46.
assessing differential expression in microarray experiments. http://www.statsci.org/smyth/pubs/ebayes.pdf

参见----------See Also----------

comp.FC, comp.modt, comp.stat
comp.FC，comp.modt，comp.stat


举例----------Examples----------


X <- matrix(rnorm(1000,0,0.5), nc=10)
L <- rep(0:1,c(5,5))

# genes 1-10 are differentially expressed[差异表达基因的1-10]
X[1:10,6:10]<-X[1:10,6:10]+1
fmod <- comp.modF(L)
fmod.X <- fmod(X)

# Another way of computing moderated F statistics[另一种计算方式缓和F统计]
fmod.X <- comp.stat(X, L, "modf")

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