R语言 DEDS包 comp.FC()函数中文帮助文档(中英文对照)

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comp.FC(DEDS)
comp.FC()所属R语言包：DEDS

                                        Computing Fold Change for Differential Expression
                                         计算倍差异表达

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

comp.FC returns a function of one argument with bindings for L, is.log and FUN. This function accepts a microarray data matrix as its single argument, when evaluated, computes fold change for each row of the matrix.
comp.FC返回一个参数的函数绑定L，is.log和FUN。这个函数接受评估时，作为单个参数的微阵列数据矩阵，计算矩阵的每一行的倍数变化。


用法----------Usage----------


comp.FC(L = NULL, is.log = TRUE, FUN = mean)



参数----------Arguments----------

参数：L
A vector of integers corresponding to observation (column) class labels. For k classes, the labels must be integers between 0 and k-1.
观察（列）类的标签对应的整数向量。对于k类，标签必须是0k-1之间的整数。


参数：is.log
A logical variable indicating whether the data has been logged.
已记录的数据是否表明一个逻辑变量。


参数：FUN
The summary statistics function used to calculate fold change, the default is set as mean, the user can also use median </table>
汇总统计功能用来计算倍数变化，默认设置为mean，用户也可以使用median</ TABLE>


Details

详情----------Details----------

The function returned by comp.FC calculates fold change for each row of the matrix, given specific class labels. If is.log=TRUE, fold change is calculated by subtraction; if is.log=FALSE, fold change is calculated by division.
comp.FC返回的函数矩阵的每一行计算倍的变化，给出具体的类标签。如果is.log=TRUE，fold change减法计算;如果is.log=FALSE，倍数变化计算按部门。


值----------Value----------

comp.FC returns a function with bindings for L, is.log and FUN, which calculates and returns a vector of fold changes for each row in the data matrix.
comp.FC返回绑定L的功能，is.log和FUN，计算并返回一个数据矩阵中的每一行的fold change的向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Yuanyuan Xiao, <a href="mailto:yxiao@itsa.ucsf.edu">yxiao@itsa.ucsf.edu</a>, <br>
Jean Yee Hwa Yang, <a href="mailto:jean@biostat.ucsf.edu">jean@biostat.ucsf.edu</a>.




参见----------See Also----------

comp.t,comp.F
comp.t，comp.F


举例----------Examples----------


X <- matrix(rnorm(1000,0,0.5), nc=10)
L <- rep(0:1,c(5,5))

# genes 1-10 are differentially expressed[差异表达基因的1-10]
X[1:10,6:10]<-X[1:10,6:10]+1

f <- comp.FC(L=L)
f.X <- f(X)

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