R语言 DECIPHER包 BrowseSequences()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

BrowseSequences(DECIPHER)
BrowseSequences()所属R语言包：DECIPHER

                                         View Sequences In A Web Browser
                                         在Web浏览器查看序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Opens an html file in a web browser to show the sequences in a DNAStringSet.
打开一个网页浏览器的HTML文件显示在DNAStringSet序列。


用法----------Usage----------


BrowseSequences(myDNAStringSet,
                htmlFile = paste(tempdir(), "/dna.html", sep = ""),
                colorBases=FALSE,
                ...)



参数----------Arguments----------

参数：myDNAStringSet
A DNAStringSet object of sequences.  
一个DNAStringSet对象序列。


参数：htmlFile
Character string giving the location where the html file should be written.  
字符串的位置应写html文件。


参数：colorBases
Logical specifying whether to color each type of base (A, C, G, and T) the same color.  
逻辑指定是否每个基本类型（A，C，G和T）相同颜色的着色。


参数：...
Additional arguments to be passed directly to ConsensusSequence.  
额外的参数直接传递到ConsensusSequence。


Details

详情----------Details----------

Some web browsers cannot quickly display a large amount data, so it is recommended to use color = FALSE (the default) when viewing a large DNAStringSet.
一些网页浏览器可以快速显示大量数据，因此建议使用color = FALSE（默认）时，观看大型DNAStringSet。


值----------Value----------

Creates an html file containing sequence data and opens it in a web browser for easy viewing.  The viewer has the sequence name on the left, position legend on the top, number of characters on the right, and consensus sequence on the bottom.
创建一个HTML文件，其中包含序列数据，为便于观看的网页浏览器中打开它。观众顶端的左侧，位置传奇的序列名称，右边的字符数，并达成共识底部的序列。

Returns TRUE if the html file was written successfully.
返回TRUE如果HTML文件被成功写入。


作者（S）----------Author(s)----------



Erik Wright <a href="mailtoECIPHER@cae.wisc.edu">DECIPHER@cae.wisc.edu</a>




参见----------See Also----------

BrowseDB
BrowseDB


举例----------Examples----------


db <- system.file("extdata", "Bacteria_175seqs.sqlite", package="DECIPHER")
dna <- SearchDB(db)
BrowseSequences(dna[1:5], colorBases=TRUE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。