找回密码
 注册
查看: 510|回复: 0

R语言 DAVIDQuery包 getAffyProbesetList()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 16:15:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
getAffyProbesetList(DAVIDQuery)
getAffyProbesetList()所属R语言包:DAVIDQuery

                                         Retrieve Affy probeset IDs from DAVID.
                                         从大卫检索Affy probeset标识。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a given Affymetrix microarray chip, retrieve Affy probeset IDs from DAVID.  Optionally,  a menu is used to pick the chip name.
对于一个给定的Affymetrix公司的微阵列芯片,从大卫检索Affy probeset标识。另外,一个菜单用于选择芯片的名称。


用法----------Usage----------


getAffyProbesetList(chipname = NULL, menu = TRUE, verbose=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:chipname
Full name or regular expression.  
全名或正则表达式。


参数:menu
Select chipname from a menu (default=TRUE)  
(默认值= TRUE,从菜单选择)chipname


参数:verbose
Print a bit of tracing information along the way (default=FALSE) .  
打印前进的道路上(默认为FALSE)跟踪信息位。


Details

详情----------Details----------

If menu==TRUE, DAVID's table of chip names is retrieved.  If chipname is a regular expression, then the menu (if requested) is subsetted accordingly.  When the user selects or specifies one of the names, the associated file of probeset names is retrieved, again directly from DAVID, not from Affymetrix.
如果menu==TRUE,大卫的芯片名称检索表。 chipname如果是一个正则表达式,然后选择菜单(如果要求)相应的子集。当用户选择或指定一个名称,检索probeset名关联的文件,再直接从大卫,而不是由Affymetrix公司。


值----------Value----------

Character vector of probeset names with 'chipType' attribute containing the chip name.
的“chipType含有芯片的名称属性probeset名称的字符向量。


注意----------Note----------

Use with caution. The returned file is not guaranteed to be correct. In the example above, with the chip "Human Genome U133 Plus 2.0", the list returned includes 40907 probeset IDs on the chip (and no others), but appears to be missing 13768 others.
谨慎使用。返回的文件不能保证是正确的。在上面的例子中,与芯片"Human Genome U133 Plus 2.0",返回列表中包括40907 probeset的ID芯片(没有其他人),但似乎失踪13768人。


作者(S)----------Author(s)----------


Roger Day, Alex Lisovich



举例----------Examples----------


head(getAffyProbesetList("Human Genome U133 Plus 2.0", menu=FALSE, verbose=TRUE))
## Not run: [#无法运行:]
length(getAffyProbesetList("133|95"))

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-2-12 08:52 , Processed in 0.030138 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表