findSimilar(cummeRbund)
findSimilar()所属R语言包:cummeRbund
findSimilar
findSimilar
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Returns a CuffGeneSet containing n genes with the most similar expression profiles to gene/profile x.
返回最相似的表达谱基因/个人资料x 1 CuffGeneSet含N基因。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'CuffSet'
findSimilar(object, x, n)
参数----------Arguments----------
参数:object
A object of class 'CuffSet'
一个对象的类的CuffSet“
参数:x
A 'gene_id' or 'gene_short_name' from which to look up an expression profile OR a vector of expression values to compare all genes (vector must have same length and order of 'samples')
一个“gene_id”或“gene_short_name从中查找表达式配置文件或表达式的值比较所有基因的向量(向量必须具有相同的长度和”样本“为了)
参数:n
Number of similar genes to return
类似的基因数量返回
Details
详情----------Details----------
By default, returns a CuffGeneSet object with n similar genes. This may change in the future.
默认情况下,返回一个n个类似的基因CuffGeneSet对象。这可能在未来改变。
值----------Value----------
A CuffGeneSet object of n most similar genes to x.
一个对象x的n个最相似的基因CuffGeneSet。
注意----------Note----------
None
没有
作者(S)----------Author(s)----------
Loyal A. Goff
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
a<-readCufflinks(system.file("extdata", package="cummeRbund"))
mySimilarGenes<-findSimilar(a,"PINK1",10)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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