R语言 cummeRbund包 diffData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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diffData(cummeRbund)
diffData()所属R语言包：cummeRbund

                                         Differential comparison data
                                         差的比较数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An accessor method to retrieve differential expression data from a 'CuffData', 'CuffFeatureSet', or 'CuffFeature' object
一个检索从一个CuffData，CuffFeatureSet或“CuffFeature的对象差异表达数据的存取方法


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CuffData'
diffData(object, x, y, features=FALSE, lnFcCutoff=20)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of class ('CuffData' or 'CuffFeatureSet')  
一个类的对象（“CuffData或CuffFeatureSet）


参数：x
Optional, if x and y are both missing, data for all pairwise differential comparisons are returned, otherwise if x and y are sample names from the 'samples' table, than only differential data pertaining to those two samples are returned.  
可选的，如果x和y都失踪，所有成对差比较的数据返回，否则，如果x和y是从“样本”表样品名称不仅仅是差有关这两个样本的数据，返回。


参数：y
See 'x'  
X


参数：features
A logical value that returns all feature-level data as part of data.frame when true.  object must be of class 'CuffData'.  
一个逻辑值，作为数据框时，真正的一部分返回的所有功能级数据。对象必须是类“CuffData。


参数：lnFcCutoff
For plotting purposes, extreme values of ln_fold_change are removed from view. This is the cutoff for where these should be trimmed.  
的极端值ln_fold_change的图的目的，是从视图中删除。这是为这些应修剪截止。


参数：...
Additional arguments.  
额外的参数。


Details

详情----------Details----------

None
没有


值----------Value----------

A data.frame object
数据框对象


注意----------Note----------

None
没有


作者（S）----------Author(s)----------



Loyal A. Goff




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


        data(sampleData)
        diff<-diffData(sampleGeneSet) #returns a dataframe of differential expression data from sample CuffGeneSet object.[返回，从样品CuffGeneSet对象的差异表达数据dataframe。]

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