csCluster(cummeRbund)
csCluster()所属R语言包:cummeRbund
csCluster
csCluster
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Returns a ggplot2 plot object with geom_line layer plotting FPKM values over conditions faceted by k-means clustering clusters. (Euclidean). This is very crude at this point. This does not return any of the clustering information directly, but if you want it, you can retrieve it from the ggplot object returned.
返回与geom_line图FPKM值以上条件的K-means聚类簇面层ggplot2图对象。 (欧几里德)。在这一点上,这是非常粗。这并不返回任何聚类信息直接,但如果你想让它,您可以检索从ggplot返回的对象。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'CuffFeatureSet'
csCluster(object,k,iter.max=100,...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of class CuffFeatureSet.
对象类CuffFeatureSet。
参数:k
Number of pre-defined clusters to attempt to find.
预先定义的簇数,以试图找到。
参数:iter.max
Max iterations
最大迭代
参数:...
Additional arguments
额外的参数
Details
详情----------Details----------
Uses 'kmeans' function.
用途“KMEANS”功能。
作者(S)----------Author(s)----------
Loyal A. Goff
源----------Source----------
None
没有
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
data(sampleData)
csCluster(sampleGeneSet,4)
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注:
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