R语言 ctc包 hclust2treeview()函数中文帮助文档(中英文对照)

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hclust2treeview(ctc)
hclust2treeview()所属R语言包：ctc

                                        Hierarchical clustering and treeview export
                                         层次聚类和TreeView出口

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function compute hierachical clustering with function hcluster and export cluster to treeview files format.
此功能计算与功能hcluster分层次聚类和出口聚类TreeView的文件格式。


用法----------Usage----------


hclust2treeview(x,file="cluster.cdt",method = "euclidean",link = "complete",keep.hclust=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：x
numeric matrix or a data frame or an object of class "exprSet".
数字矩阵或一个数据框或类“exprSet”的对象。


参数：file
File name of export file.
导出文件的文件名。


参数：method
the distance measure to be used. This must be one of "euclidean", "maximum", "manhattan", "canberra" "binary" "pearson", "correlation" or  "spearman". Any unambiguous substring can be given.
要使用的距离度量。这必须是一个"euclidean"，"maximum"，"manhattan"，"canberra""binary""pearson"，"correlation"或"spearman" 。可以给出任何明确的子串。


参数：link
the agglomeration method to be used. This should be (an unambiguous abbreviation of) one of "ward", "single", "complete", "average", "mcquitty", "median" or "centroid".
结块的方法来使用。这应该是（一个明确的缩写）"ward"，"single"，"complete"，"average"，"mcquitty"，"median"或<X >


参数：keep.hclust
if TRUE: function returns a list of 2 objects of class hclust
如果为TRUE，函数返回一个2类hclust对象的名单


Details

详情----------Details----------

This function producte all 3 files needed by treeview, with
此功能producte所有3个文件的TreeView的需要，


值----------Value----------

if keep.hclust = FALSE, function return 1. else function returns 2 objects of class hclust, first: hierachical clustering by rows, second: hierarchical clustering by columns
如果keep.hclust = FALSE时，函数返回1。其他函数返回列2类hclust对象，首先由层次聚类：按行分层次聚类，第二


作者（S）----------Author(s)----------


Antoine Lucas, <a href="http://mulcyber.toulouse.inra.fr/projects/amap/">http://mulcyber.toulouse.inra.fr/projects/amap/</a>



参考文献----------References----------

for Huge Clustering, R News, 2006, vol 6, issue 5 pages 58-60.

参见----------See Also----------

hclust
hclust


举例----------Examples----------



data(USArrests)
hclust2treeview(USArrests,file="cluster.cdt")


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