R语言 crlmm包 CNSet-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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CNSet-methods(crlmm)
CNSet-methods()所属R语言包：crlmm

                                        crlmm methods for class "CNSet"
                                         crlmm CNSet“类”的方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

CNSet is a container defined in the oligoClasses package for storing normalized intensities for genotyping platforms, genotype calls, and parameters estimated for copy number. Accessors for data that an object of this class contains are largely defined in the package oligoClasses. CNSet methods that involve more complex calculations that are specific to the crlmm package, such as computing allele-specific copy number, are included in crlmm and described here.
CNSet一个容器是定义在oligoClasses包装存储归强度基因分型平台，基因型分型，拷贝数估计的参数。在很大程度上，这个类的对象包含的数据存取定义包oligoClasses。 CNSet的方法，涉及更复杂的计算，具体的crlmm包，如计算等位基因特异性拷贝数，包括在crlmm和这里描述。


方法----------Methods----------




CA signature(object="CNSet"): calculates raw copy number
CA的signature(object="CNSet")：计算原始拷贝数




CB signature(object="CNSet"): calculates raw copy
会CBsignature(object="CNSet")：计算原始副本




lines signature(x="CNSet"): plot ellipses (95th
线signature(x="CNSet")：图省略号（95




totalCopynumber signature(object="CNSet"): calculates
totalCopynumbersignature(object="CNSet")：计算




rawCopynumber signature(object="CNSet"): same as totalCopynumber
rawCopynumbersignature(object="CNSet")：作为totalCopynumber相同




nuA signature(object="CNSet"): estimate of mean
NUAsignature(object="CNSet")：估计平均




nuB signature(object="CNSet"): estimate of mean
NUBsignature(object="CNSet")：估计平均




phiA signature(object="CNSet"): estimate of slope coefficient (intensity-scale) for allele A
PHIAsignature(object="CNSet")：A等位基因估计斜率系数（强度级）




phiB signature(object="CNSet"): estimate of slope coefficient (intensity-scale) for allele B
phiBsignature(object="CNSet")：B等位基因的估计斜率系数（强度级）




Ns signature(object="CNSet"): genotype frequencies
NSsignature(object="CNSet")：基因型频率




corr signature(object="CNSet"): correlation of
更正signature(object="CNSet")：相关




mads signature(x="CNSet"): ...
的MADSsignature(x="CNSet")：...




medians signature(object="CNSet"): ...
中线signature(object="CNSet")：...




tau2 signature(object="CNSet"): ...
tau2signature(object="CNSet")...


参见----------See Also----------

CNSet-class, CA, CB, totalCopynumber, rawCopynumber
CNSet-class，CA，CB，totalCopynumber，rawCopynumber

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