CRImage-package(CRImage)
CRImage-package()所属R语言包:CRImage
CRImage is a package to analyze images and classify cells.
CRImage是一个包到的图像分析和分类单元。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
CRImage allows classification of cells in biological images. It offers methods to segment cells or cell nuclei in biological images for example HE stained images. It offers methods to create a classifier and to classify cells in these images. Furthermore it allows the calculation of tumour cellularity for large microscope images.
CRImage让单元在生物图像分类。它提供了部分单元或单元的单元核的生物,例如图像,HE染色图像的方法。它提供的方法来创建一个分类和分类这些图像中的单元。此外,它允许大型显微镜图像的肿瘤单元数的计算。
CRImage makes use of the image processing package EBImage, which uses the 'ImageMagick' library for image I/O operations and the 'GTK' library to display images.
CRImage使得利用图像处理包EBImage图像I / O操作,它使用“ImageMagick的”图书馆“GTK库显示图像。
Details
详情----------Details----------
包装内容----------Package content----------
Image processing methods:
图像处理方法:
calculateThreshold
calculateThreshold
segmentImage
segmentImage
Classification:
分类:
createTrainingSet
createTrainingSet
createClassifier
createClassifier
classifyCells
classifyCells
Tumour cellularity
肿瘤单元结构
calculateCellularity
calculateCellularity
processAperio
processAperio
作者(S)----------Author(s)----------
Henrik Failmezger, <failmezger@cip.ifi.lmu.de>
Yinyin Yuan, <Yinyin.Yuan@cancer.org.uk>
Oscar Rueda, <oscar.rueda@cancer.org.uk>
Florian Markowetz, <florian.markowetz@cancer.org.uk>
CRI Cambridge
Li Ka Shing Centre
Robinson Way
Cambridge, CB2 0RE, UK
Ludwigs-Maximilians University of Munich
举例----------Examples----------
example(segmentImage)
example(createClassifier)
example(classifyImage)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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