R语言 cosmo包 palCon-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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palCon-class(cosmo)
palCon-class()所属R语言包：cosmo

                                        Class "palCon"
                                         类“palCon”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class defines a global constraint when palindromic patterns are known to be found in the motif.
这个类定义了一个全球性的约束时，被称为回文图案主题。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form   new('palCon',<br>     int1       = ...., # Object of class numeric<br>     int2       = ...., # Object of class numeric<br>     errBnd     = ...., # Object of class numeric<br>   ) or by:   makePalCon(<br>     int1       = ...., # Object of class numeric<br>     int2       = ...., # Object of class numeric<br>     errBnd     = ...., # Object of class numeric<br>   )
对象可以创建形式  new('palCon',参考    int1       = ...., # Object of class numeric参考    int2       = ...., # Object of class numeric参考    errBnd     = ...., # Object of class numeric参考  )或检测：   makePalCon(参考    int1       = ...., # Object of class numeric参考    int2       = ...., # Object of class numeric参考    errBnd     = ...., # Object of class numeric参考  )


插槽----------Slots----------




int1: Object of class "numeric" first palindromic interval
int1：对象类"numeric"第一个回文的时间间隔




int2: Object of class "numeric" second palindromic interval
int2类"numeric"第二回文间隔对象




errBnd: Object of class "numeric" error tolerated in mismatches
errBnd类"numeric"错误的对象容忍不匹配


方法----------Methods----------

No methods defined with class "palCon" in the signature.
没有任何方法定义类的“palCon”签名。


作者（S）----------Author(s)----------



Fabian Gallusser, <a href="mailto:fgallusser@berkeley.edu">fgallusser@berkeley.edu</a>




参见----------See Also----------

shapeCon, subMotifCon, posFreqCon, boundCon, shapeDiffCon makeConSet
shapeCon，subMotifCon，posFreqCon，boundCon，shapeDiffConmakeConSet


举例----------Examples----------


set=makeConSet(3,c("B","V","B"),c(4,NA,4))
palcon=makePalCon(1,3,0.5)
set=addCon(set,list(palcon),NA)

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