R语言 cosmo包 makeSubMotifCon()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

makeSubMotifCon(cosmo)
makeSubMotifCon()所属R语言包：cosmo

                                        Constructing a submotif constraint
                                         构建submotif约束

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function constructs a subMotifCon object representing a constraint on the unknown position weight matrix that requires the motif to contain a given submotif
这个函数构造一个subMotifCon对象代表一个未知的位置权重矩阵的约束，要求主题包含一个给定的submotif


用法----------Usage----------


makeSubMotifCon(submotif, minfreq)



参数----------Arguments----------

参数：submotif
character the submotif
charactersubmotif


参数：minfreq
numeric roughly, the minimum frequency with which nucleotides in the submotif must occur in the motif
numeric大致与最低频率核苷酸的submotif必须发生在序


值----------Value----------

An object of class subMotifCon.
对象类subMotifCon。


作者（S）----------Author(s)----------



Fabian Gallusser, <a href="mailto:fgallusser@berkeley.edu">fgallusser@berkeley.edu</a>




参见----------See Also----------

boundCon, shapeCon, subMotifCon, posFreqCon, shapeDiffCon, palCon
boundCon，shapeCon，subMotifCon，posFreqCon，shapeDiffCon，palCon


举例----------Examples----------


pfc <- makeSubMotifCon("CGC", 0.8)

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