R语言 cosmo包 makePosFreqCon()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

makePosFreqCon(cosmo)
makePosFreqCon()所属R语言包：cosmo

                                        Constructing a nucleotide frequency constraint
                                         构建核苷酸频率约束

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function constructs a posFreqCon object representing a constraint on the unknown position weight matrix that requires the frequency of a given nucleotide to be above a given lower bound, either at a single position in a given interval, or on average across the entire interval
这个函数构造一个posFreqCon对象代表一个未知的，需要一个特定核苷酸的频率，是一座横跨于给定的下限，在一个给定的时间间隔的单一位置，或平均位置权重矩阵约束整个区间


用法----------Usage----------


makePosFreqCon(pos, nuc, lower)



参数----------Arguments----------

参数：pos
This is either the string avg, indicating that the average nucleotide frequency across the interval is bounded from below, or a position in the interval, indicating the nucleotide frequency at that position in the interval is bounded from below.
这可以是字符串avg，表明整个区间核苷酸的平均频率从以下范围内，或在区间的位置，这表明，在间隔位置的核苷酸频率从下面界。


参数：nuc
character This is one of A, C, G, T, GC, AT.
character这是一个A，C，G，T，GC，AT。


参数：lower
numeric the lower bound on the nucleotide frequency of interest
numeric下界利益的核苷酸频率


值----------Value----------

An object of class posFreqCon.
对象类posFreqCon。


作者（S）----------Author(s)----------



Fabian Gallusser, <a href="mailto:fgallusser@berkeley.edu">fgallusser@berkeley.edu</a>




参见----------See Also----------

boundCon, shapeCon, subMotifCon, posFreqCon, shapeDiffCon, palCon
boundCon，shapeCon，subMotifCon，posFreqCon，shapeDiffCon，palCon


举例----------Examples----------


pfc <- makePosFreqCon("avg","GC", 0.75)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。