cor.unbalance(CORREP)
cor.unbalance()所属R语言包：CORREP
Multivariate Correlation Estimator (Unequal Number of Replicates)
多元相关估计（复制不等数）
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
cor.unbalance estimates correlation from replicated data of unequal number of replicates. different from cor.balance, cor.unbalance takes a pair of variables at a time because of unequal number of replicates. the variance of each row of the data MUST equal to 1 (see example below)
cor.unbalance估计从数据复制复制不平等的相关性。不同的cor.balance，cor.unbalance因为不平等的数量，时间发生在一对变量复制。每一行数据的方差必须等于1（见下面的例子）
用法----------Usage----------
cor.unbalance(x, m1, m2)
参数----------Arguments----------
参数：x
data matrix, column represents samples (conditions), and row represents variables (genes), see example below for format information
数据矩阵，列代表样本（条件），行代表变量（基因），见下面的例子的格式信息
参数：m1
number of replicates for one variable (gene)
数复制一个变量（基因）
参数：m2
number of replicates for another variable (gene)
数复制另一个变量（基因）
Details
详情----------Details----------
The multivariate correlation estimator assumes replicated omics data are iid samples from the multivariate normal distribution. It is derived by maximizing the likelihood function. Note that the off-diagonal elements in the returned correlation matrix (G by G) is the average of off-diagonals of MLE of correlation matrix of a pair of variables (m1+m2 by m1+m2).
多元相关估计，假设复制组学数据是独立同分布多元正态分布的样本。它是派生的似然函数最大化。请注意，在返回的相关矩阵（由G G）的非对角线元素是一对变量（M1 + M2由M1 + M2）的相关矩阵的MLE的对角线平均。
值----------Value----------
A correlation matrix containing only one distinct correlation coefficient for the pair of variables (genes)
对变量（基因）包含只有一个明显的相关系数相关矩阵
作者（S）----------Author(s)----------
Dongxiao Zhu and Youjuan Li
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
cor.unbalance, cor
cor.unbalance，cor
举例----------Examples----------
library("CORREP")
d0 <- NULL
for(l in 1:10)
d0 <- rbind(d0, rnorm(8))
## The simulated data corresponds to the real-world data of 2 genes and 10 conditions, gene expression[＃模拟数据对应2基因在现实世界中的数据和10条件下，基因表达]
## profiles were replicated 3 and 5 times. [＃配置文件被复制的3倍和5倍。]
## Note this function can only take calculate correlation matrix between two genes at a time.[＃注意：此功能只能采取两个基因之间的相关性矩阵计算一次。]
d0<- t(d0)
## This step is to make the standard deviation of each replicate equal to 1[＃这一步是让每个复制的标准差等于1]
## so that we can model the covariance matrix as correlation matrix.[＃所以，我们可以模拟相关矩阵的协方差矩阵。]
d0.std <- apply(d0, 1, function(x) x/sd(x))
M <- cor.unbalance(t(d0.std), m1=3, m2=5)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 15:54:07
