R语言 coRNAi包 InteractLevelPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

InteractLevelPlot(coRNAi)
InteractLevelPlot()所属R语言包：coRNAi

                                         function to visualize interactions as a levelplot
                                         功能，可视化的交互1 levelplot

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

visualizes significant interactions as a levelplot
可视化1 levelplot显着交互作用


用法----------Usage----------


InteractLevelPlot(toptable, thresh = 0.001, by = "P.Value", key = FALSE, col.regions = colorRampPalette(c("blue", "white", "yellow")),zerolimit=0)



参数----------Arguments----------

参数：toptable
toptable table from function topTable  
toptable表从功能topTable


参数：thresh
thresh numeric, threshold for significance  
thresh数字，阈值的意义


参数：by
by column in topTable that thresh should be applied to  
by列，阈值应适用于在topTable


参数：key
key optional, data frame with groupings of the genes in the toptable   
key可选，数据框的基因组中的toptable


参数：col.regions
col.regions colors to be used  
col.regions要使用的颜色


参数：zerolimit
zerolimit threshold below which interactions should be colored as 0.  
zerolimit阈值，低于该相互作用应着色为0。


值----------Value----------

a levelplot, pdf files with graphs
1 levelplot，图的PDF文件


作者（S）----------Author(s)----------



Elin Axelsson




参见----------See Also----------

levelplot
levelplot


举例----------Examples----------


# similated data[similated数据]
data(screen1_raw)
df = cellHTS2df(screen1_raw,neutral="Fluc")
tt = data.frame("ID"=(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),"size"=runif(length(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),-2,2),stringsAsFactors=FALSE)
InteractLevelPlot(tt,thres=0,by="size")

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注：
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