data2graph(coRNAi)
data2graph()所属R语言包：coRNAi
Function to create .dot files for graph representation of data
函数来创建图表示数据点文件。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
From a interaction table or list of data matrices a .dot file is created for visualisation of the interaction/correlation network
从交互表或数据矩阵列表文件被创建。点互动/相关网络可视化
用法----------Usage----------
data2graph(indata, sizethres=0, thres, thresBy = "P.Value", cols = c("blue", "white", "red"), gamma.col = 1, scaleFactor = 1, nodecolor = "white", writedot = FALSE, filename, width=0.1, penwidth=1, shape='circle', fixedsize=TRUE,fontsize=10)
参数----------Arguments----------
参数：indata
参数：sizethres
numerical, lower treshold on the absolute effect size for edges
数值，较低的传输安全性上绝对的边缘效应大小
参数：thres
threshold that should be used for interactions/correlations to be included in graph
图中包括阈值应为互动/相关
参数：thresBy
what data should the the threshold by used at. By default the p value from the moderated t test is used but one could also use e.g. the ordinary t or the size
什么样的数据应该使用的阈值。默认情况下，从主持的t检验的P值是使用，但也可以使用如普通T或大小
参数：cols
colors to be used in the plot, should be a character vector with the colors for low, neutral and hig values
要在图中使用的颜色，应该是一个特征向量为低，中性和HIG值的颜色
参数：gamma.col
Factor used to scale the colors
用于扩展的颜色的因素
参数：scaleFactor
Scale factor to adjust the distances beteen nodes in the graph
规模因素调整图中的距离承继节点
参数：nodecolor
character or character vector, which color(s) should the nodes have. Should either be of lenth 1 (all nodes same color) or same length as the number of nodes.
字符或向量，它的颜色（S）节点。应该是全长1（相同颜色的所有节点）或节点数目相同的长度。
参数：writedot
logical, should a .dot file be created.
逻辑，应该。dot文件被创建。
参数：filename
charcter string with name of .dot file
charcter字符串。dot文件名称
参数：width
width of the nodes
节点的宽度
参数：penwidth
width of the lines in the plot
图线的宽度
参数：shape
shape of the nodes in the plot
在图中的节点形状
参数：fixedsize
should all nodes have the same size
所有节点应具有相同的大小
参数：fontsize
size of the font in the plot
在图的字体大小
值----------Value----------
a .dot file is written if writefile argument is TRUE
如果WriteFile的参数为TRUE。点文件被写入
参数：ninf
Dataframe with information about the nodes in the network
Dataframe与网络节点的信息
参数：einfo
Dataframe with information about the edges in the network
在网络边缘信息Dataframe
作者（S）----------Author(s)----------
Greg Pau, Elin Axelsson
参见----------See Also----------
Also see Graphviz documantation http://www.graphviz.org/
也看到Graphviz的documantation http://www.graphviz.org/~~V
举例----------Examples----------
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 15:50:40
