R语言 coRNAi包 cortestmatrices()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cortestmatrices(coRNAi)
cortestmatrices()所属R语言包：coRNAi

                                         Function to extract correlations and corresponding p-values from interaction matrix.
                                         提取相关的功能和相应的相互作用矩阵的p值。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a wrapper function for cor.test, given a matrix of interaction values, correlations and corresponding p-values for the genewise interaction profiles are calculated.
这是一个包装函数cor.test，互动的价值观，相关和相应的p值2-6。互动型材计算矩阵。


用法----------Usage----------


cortestmatrices(mat, method = c("pearson", "kendall", "spearman"))



参数----------Arguments----------

参数：mat
mat interaction matrix  
mat相互作用矩阵


参数：method
character deciding which correlation method should be used  
性格决定应使用的相关法


值----------Value----------

List of two matrices
两个矩阵名单


参数：cor.matrix
matrix with correlations
与相关矩阵


参数：p.matrix
matrix with p-values
p值的矩阵


作者（S）----------Author(s)----------



Elin Axelsson




参见----------See Also----------

cor.test
cor.test


举例----------Examples----------


## simulate data with 2 genes with similar profiles[＃模拟数据与2个基因具有类似型材]

mat = matrix(rnorm(100*100,0,1),100,100)
pr = sample(2:10,100,replace=TRUE)
mat[1:2,] = mat[1:2,] + matrix(pr,ncol=100,nrow=2,byrow=TRUE)
mat = mat+t(mat)
diag(mat) = NA
dimnames(mat)=list(1:100,1:100)
res = cortestmatrices(mat,method="spearman")
cors= res[[1]]
ps = res[[2]]
print(which(ps==min(ps,na.rm=TRUE),arr.ind=TRUE))


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