找回密码
 注册
查看: 466|回复: 0

R语言 codelink包 readCodelink()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 15:47:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
readCodelink(codelink)
readCodelink()所属R语言包:codelink

                                        Read Codelink Bioarrays Data
                                         阅读Codelink Bioarrays数据

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read data exported as text by Codelink Software. It reads values (normalized by Codelink Software or not) flags and information about probes.
读取数据导出为文本Codelink软件。它读取值(Codelink软件或不归)的标志和有关探测资料。


用法----------Usage----------


    readCodelink(files=list.files(pattern="TXT"), sample.name=NULL,
        flag, dec=NULL, type="Spot",        preserve=FALSE,        verbose=2,
        file.type="Codelink", check=TRUE, fix=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:files
list of files to read.
文件列表读取。


参数:sample.name
vector of same length as files with sample names.
样品名称相同的文件长度的向量。


参数:flag
list with values to assign based on Flag quality values.
分配的基础上旗质量值与值列表。


参数:dec
character indicating the decimal character used in the files.
字符显示在文件中使用的十进制字符。


参数:type
character indicating which base value to read from files.
基值从文件中读取字符显示。


参数:preserve
logical, if TRUE Bkgd\_stdev slot is not removed (if present).
逻辑,如果真BKGD \ _stdev槽不会被删除(如果存在)。


参数:verbose
numerical, set the level of information. Level 2 set as old behaviour. Level > 2 output some debug info.
数值,设置的信息化水平。旧的行为定为2级。等级> 2输出一些调试信息。


参数:file.type
exported file type, currently Codelink or XLS file formats supported.
导出的文件类型,目前Codelink或XLS文件格式支持。


参数:check
logical, check for probe order consistency.
逻辑,检查探测顺序的一致性。


参数:fix
logical, try to fix probe order consistency.
逻辑,尝试修复探测顺序的一致性。


值----------Value----------

An object of class "Codelink".
对象一个类“Codelink”。


作者(S)----------Author(s)----------


Diego Diez



参见----------See Also----------

read.table
read.table


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
    # reading default extension (TXT).[读取默认的扩展名(TXT)。]
    data <- readCodelink()

    # specify a different one.[指定一个不同的。]
    files <- list.files(pattern = "txt")
    data <- readCodelink(files = files)

    # example.[例子。]
    data(codelink.example)

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-2-12 19:50 , Processed in 0.029650 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表