R语言 codelink包 normalize()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalize(codelink)
normalize()所属R语言包：codelink

                                        Normalization wrapper for Codelink objects.
                                         Codelink对象的标准化包装。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes a Codelink object and applies normalization to intensity values.
需要Codelink对象，并适用于强度值的标准化。


用法----------Usage----------


    normalize(object, method = "quantiles", log.it = TRUE, preserve = FALSE,
                weights = NULL, verbose = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of class "Codelink".
对象一个类“Codelink”。


参数：method
method to use in normalization.
在标准化的使用方法。


参数：log.it
logical; if data should be log2.
逻辑;如果数据应该是的log2。


参数：preserve
logical; if Ri slot should be preserved.
逻辑;如果RI槽应予以保留。


参数：weights
weights vector for method CyclicLoess.
权重向量方法CyclicLoess。


参数：verbose
should informative output be printed.
应该被打印信息输出。


Details

详情----------Details----------

Currently supported methods include "loess", "quantiles" and "median".   Median normalization is analogous to the default method applied for the  manufacturer in the Codelink software. Loess is a modified version of  CyclicLoess implemented in the affy package, allowing missing values and  weights. Quantile normalization uses the normalizeQuantiles() function in the  limma package.
目前支持的方法包括“黄土”，“位数”和“中位数”。中位数标准化是类似于默认方法为在Codelink软件制造商的应用。黄土高原是实施CyclicLoess在affy包的修改后的版本，允许缺失值和权重。分量标准化使用在limma包的的normalizeQuantiles（）函数。


值----------Value----------

A Codelink object with normalized intensity values.
一个归强度值Codelink对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Diego Diez



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(codelink.example)
        # Background correction.[背景校正。]
        codelink.example <- bkgdCorrect(codelink.example,
        method = "half")
        # Normalization.[标准化。]
        codelink.example <- normalize(codelink.example,
        method = "quantile")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。