fc2Cond(codelink)
fc2Cond()所属R语言包:codelink
Select probes based on fold change calculation
选择倍计算为基础的探针
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Takes a Codelink object and calculate fold changes (M) between two conditions (samples). Then select genes based on those who pass the passed cutoff.
需要Codelink对象和计算之间的两个条件(样品)(男)倍的变化。然后选择基于那些通过传递截止基因。
用法----------Usage----------
fc2Cond(object, cond1=NULL, cond2=NULL, fc=1.0, verbose=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:object
an object of class "Codelink".
对象一个类“Codelink”。
参数:cond1
numeric or character; First condition to compute M.
数字或字符;计算研究的首要条件
参数:cond2
numeric or character; Second condition to compute M.
数字或字符;第二个条件计算研究
参数:fc
value of the fold change cutoff
价值倍截止
参数:verbose
logical; if some information is printed on the console.
逻辑;如果在控制台上打印一些信息。
Details
详情----------Details----------
Conditions can be passed as characters or as numeric index from the sample slot. The intensities are internally transformed to log2 if needed. The M value is computed as:
条件可以通过字符或数字索引从样品槽。如果需要的话,强度内部转化到log2。 M值计算如下:
M = cond1 - cond2
M = COND1 - COND2
值----------Value----------
A logical vector indicating which genes pass the cutoff
逻辑向量,说明哪些基因传递截止
作者(S)----------Author(s)----------
Diego Diez
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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