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R语言 CNTools包 RS-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:39:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
RS-class(CNTools)
RS-class()所属R语言包:CNTools

                                        Class "RS" contains the Reduced Segment data matrix derived
                                         类的“RS”包含的减少分部数据矩阵衍生

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The class contains the Reduced Segment data matrix  derived from the output of the segment method of DNACopy and provides functions to manipulate the data or perform other
类包含减少分部从输出的段DNACopy方法得出的数据矩阵和提供的功能来操纵数据或执行其他


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("RS", ...). A constructor RS(rs, by, imput, XY) can also be used to intantiate  an object of this class
创建对象可以通过检测的形式new("RS", ...)。构造RS(RS,攀枝花钢铁集团,的XY),也可以用于intantiate这个类的对象


插槽----------Slots----------




rs: Object of class "ANY" eith a matrix if the RS is by region or gene or a list of matrix if the
rs:如果RS是按区域或基因或矩阵列表,如果对象的类"ANY"的eith矩阵




by: Object of class "character"  a  charactere string indicating how the RS matrix is obtained.
by:Object类的"character"charactere字符串,指示如何获得RS矩阵。


方法----------Methods----------




cor signature(x = "RS"): Calculates the sample wise
心病signature(x = "RS"):计算样本明智




dist signature(x = "RS"): Calculates the distance
区signature(x = "RS"):计算距离




genefilter signature(expr = "RS"): filters features
genefiltersignature(expr = "RS"):过滤器功能




madFilter signature(object = "RS"): filters features
madFiltersignature(object = "RS"):过滤器功能




rs signature(object = "RS"): get method for the by
RSsignature(object = "RS"):为方法




rs<- signature(object = "RS"): assignment method for
RS < - signature(object = "RS"):分配方法




segBy signature(object = "RS"): get method for the by
为segBysignature(object = "RS"):方法




show signature(object = "RS"): show method for an RS
显示signature(object = "RS")show方法:一个RS


作者(S)----------Author(s)----------


Jianhua Zhang



参见----------See Also----------

CNSeg
CNSeg


举例----------Examples----------


    data("sampleData")
    # take a subset of the data for speed[利用速度数据的一个子集]
    seg <- CNSeg(sampleData[which(is.element(sampleData[, "ID"], sample(unique(sampleData[, "ID"]), 20))), ])
    rsByregion <- getRS(seg, by = "region", imput = TRUE, XY = FALSE, what = "median")
    rsByregion

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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