exportTable(CNAnorm)
exportTable()所属R语言包:CNAnorm
Methods for Function exportTable in Package ‘CNAnorm’
功能exportTable方法包CNAnorm
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
exportTable write a table with normalised values of each window. A wrapper to "write.table"
exportTable写的每个窗口的标准化值表。到"write.table"包装
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'CNAnorm'
exportTable(object, file = "CNAnorm_table.tab", show = 'ratio',
sep = "\t", row.names = FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
an object of Class "CNAnorm"
一个对象类"CNAnorm"
参数:file
name of the file to save to
该文件的名称保存到
参数:show
what should be reported in the table: "ratio": the normalized ratio (a value of 1 means diploid). "ploidy": the same as ratio * 2. "center": report ratio centered on the most abbundand copy. Ratio of 1 means that the most abbundant “state” is centered to 1
应在报告表:"ratio":标准化比值(值1意味着二倍体)。 "ploidy":比率* 2相同。 "center":报告比上最abbundand副本中心。的最abbundant“状态”为中心1比1表示
参数:sep
the field separator string.
字段分隔符字符串。
参数:row.names
either a logical value indicating whether the row number should be written or a character vector of row names to be written.
无论是逻辑值,指明是否书面或要写入的字符向量的行名行号应。
参数:...
Extra arguments to be passed to "write.table"
额外的参数被传递"write.table"的
值----------Value----------
An object of class "CNAnorm"
一个对象的类"CNAnorm"
作者(S)----------Author(s)----------
Stefano Berri <a href="mailto:s.berri@leeds.ac.uk">s.berri@leeds.ac.uk</a>
参见----------See Also----------
write.table
write.table
举例----------Examples----------
data(CN)
CN <- validation(CN)
CN <- discreteNorm(CN)
exportTable(CN, file = "CNAnorm_table.tab", show = 'ploidy')
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注:
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