R语言 cn.mops包 XRanges()函数中文帮助文档(中英文对照)

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XRanges(cn.mops)
XRanges()所属R语言包：cn.mops

                                        A simulated data set for CNV detection from NGS data.
                                         模拟数据为CNV的检测从农工商数据。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set gives the read counts of 40 samples in 5000 genomic locations. The rows correspond to genomic segments of 25kbp length and the columns to samples. An entry is the number of reads that map to the specific segment of the sample. The "GRanges" object contains the name of the  reference sequence, start and end position of the genomic segments. The simulated data contains CNVs given in the CNVRanges object. It was generated using distributions of read counts as they appear in real sequencing experiments.  CNVs were implanted under the assumption that the expected read count is linear dependent on the copy number (e.g. in a certain genomic we expect
这组数据给出了40个样品在5000基因的位置读取计数。行对应的25kbp长度和列样品的基因组片段。一个条目的读取次数，样品的特定部分的图。 “农庄”的对象中包含的参考序列的名称，开始和结束位置的基因片段。模拟数据包含CNVRanges对象给予的CNVs。它产生的使用只读计数的分布，因为他们在真正的测序实验中出现的。 CNVs被植入的假设下，预期读取计数线性依赖某个基因拷贝数（例如：我们所期望的

reads for copy number 2, then we expect
读取拷贝数2，然后我们期待

reads for copy number 4).
读取拷贝数4）。


用法----------Usage----------


XRanges



格式----------Format----------

A GRanges object with 5000 rows and 40 value columns across 1 space.
与5000行和值为40列跨1空间农庄对象。


源----------Source----------

http://www.bioinf.jku.at/software/cnmops/cnmops.html.



参考文献----------References----------


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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