R语言 cn.farms包 plotEvalIc()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotEvalIc(cn.farms)
plotEvalIc()所属R语言包：cn.farms

                                        Creates a plot with known regions and a numeric vector
                                         创建一个区域和一个数值向量图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates a plot with known regions and a numeric vector
创建一个区域和一个数值向量图


用法----------Usage----------


  plotEvalIc(object, segments, chrom, variable, ylim,
    ylab = "CN indicator", stripCol = "lightgray",
    regionCol = rgb(130, 0, 139, max = 255),
    pointSize = 0.75, pointType = 4,
    bandwidth = c(0.01, 1000), nbin = 100)



参数----------Arguments----------

参数：object
an instance of ExpressionSet
一个ExpressionSet的实例


参数：segments
A data.frame with known regions.
与已知区域的数据框。


参数：chrom
the chromosome.
染色体。


参数：variable
The numeric vector which should be plotted.
应绘制数字向量。


参数：ylim
the limits of the y axis.
y轴的限制。


参数：ylab
the ylab from function par.
从功能面值ylab。


参数：stripCol
color of points.
颜色的点。


参数：regionCol
color of regions.
颜色的区域。


参数：pointSize
size of the points.
点的大小。


参数：pointType
type of the points.
点的类型。


参数：bandwidth
for the color of the plot.
对色彩的图。


参数：nbin
number of bins for the coloring.
数着色箱。


值----------Value----------

Some data
一些数据


作者（S）----------Author(s)----------



Andreas Mitterecker




举例----------Examples----------


load(system.file("exampleData/slData.RData", package = "cn.farms"))
load(system.file("exampleData/testSegments.RData", package = "cn.farms"))
plotEvalIc(slData, fData(testSegments),
     variable = assayData(slData)$L_z[, 1], 23)

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