distributionDistance(cn.farms)
distributionDistance()所属R语言包:cn.farms
Computes the distribution distance
计算的分布距离
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Be aware that this function is implemented quite slow.
要知道这个函数的实现相当缓慢。
用法----------Usage----------
distributionDistance(intensityData,
method = c("JSDiv", "KLDiv", "KLInf"), useSubset = T,
subsetFraction = 0.25, useQuantileReference = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:intensityData
A matrix or an AffyBatch object.
一个矩阵或AffyBatch的对象。
参数:method
The method you want to use.
您要使用的方法。
参数:useSubset
Logical. States if only a subset should be used.
逻辑。如果只有一个子集,应使用的国家。
参数:subsetFraction
The fraction of the subset.
子集的一小部分。
参数:useQuantileReference
Logical for a quantile reference.
逻辑的位数参考。
值----------Value----------
Computes the distribution distance
计算的分布距离
作者(S)----------Author(s)----------
Djork-Arne Clevert <a href="mailto kko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>
举例----------Examples----------
load(system.file("exampleData/normData.RData", package = "cn.farms"))
x <- assayData(normData)$intensity[, 1:3]
y <- distributionDistance(x)
attr(y, "Labels") <- substr(sampleNames(normData), 1, 7)
plotDendrogram(y)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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