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bioconductor中关于代谢组学的部分

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发表于 2014-8-2 00:35:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
bioconductor中目前最多的包都是关于序列识别,微阵列芯片数据分析或者说,自从next-generation-sequence时代以来重心几乎都在NGS的应用上,但是不用怀疑的是未来一定会有更多关于代谢组学的包的,也希望其中的作者能够有我们。

下面是一些我整理的代谢组学相关的包(除了bioconductor package matainer外哈):

preprocessCore 功能是:A collection of pre-processing functions

flagme  功能是:    Analysis of Metabolomics GC/MS Data

TargetSearch 功能是:    A package for the analysis of GC-MS metabolite profiling data.

PAPi  功能是:  Predict metabolic pathway activity based on metabolomics data


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发表于 2014-8-4 14:53:07 | 显示全部楼层
{:soso_e179:}感谢楼主分享1
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