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关于SAM比较分析前的过滤

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发表于 2013-8-8 09:30:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
用excel的插件SAM做分析。SAM two-class,A组比B组,A与B分别有三次生物学重复,共6个样本。在做比较前进行了一次过滤,因为数据本身有空值,所以过滤的原则是六个样本里,三个及以上为空的基因就过滤掉。但是这样过滤就会出现这样一种情况(基因),就是A组的三个样本的值都为空,B组三个样本都有值,这样,虽然用excel的插件SAM进行分析时,可以把空值补上,但不知道这样比较是否还有意义。
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