groupGO(clusterProfiler)
groupGO()所属R语言包:clusterProfiler
Functional Profile of a gene set at specific GO level.
一个基因的功能简介设置在特定的好水平。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Functional Profile of a gene set at specific GO level. Given a vector of genes, this function will return the GO profile at
一个基因的功能简介设置在特定的好水平。由于向量的基因,这个函数将返回GO个人资料
用法----------Usage----------
groupGO(gene, organism="human", ont="CC", level=2, readable=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:gene
a vector of entrez gene id.
Entrez基因身份证向量。
参数:organism
Currently, only "human" and "mouse" supported.
目前,只有“人”和“鼠标”的支持。
参数:ont
One of "MF", "BP", and "CC" subontologies.
“MF”,“BP”,“消委会”subontologies的之一。
参数:level
Specific GO Level.
具体的好水平。
参数:readable
if readable is TRUE, the gene IDs will mapping to gene symbols. </table>
如果可读为TRUE,基因标识将映射到基因符号。 </ TABLE>
值----------Value----------
A groupGOResult instance.
一个groupGOResult实例。
作者(S)----------Author(s)----------
Guangchuang Yu <a href="http://ygc.name">http://ygc.name</a>
参见----------See Also----------
groupGOResult-class, compareCluster
groupGOResult-class,compareCluster
举例----------Examples----------
yy <- groupGO(gcSample[[1]], organism="human", ont="BP", level=2)
head(summary(yy))
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