R语言 clstutils包 refpkgContents()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

refpkgContents(clstutils)
refpkgContents()所属R语言包：clstutils

                                         Read the contents of a collection of reference sequences ("refpkg").
                                         阅读参考序列的集合的内容（“refpkg”）。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read the manifest file from a refpackage and return a list containing the package contents.
manifest文件从refpackage读取并返回一个列表，其中包含包装内容。


用法----------Usage----------


refpkgContents(path, manifest = "CONTENTS.json")



参数----------Arguments----------

参数：path
path to a refpkg directory
到refpkg目录的路径


参数：manifest
name of the manifest file
列表文件的名称


值----------Value----------

Returns a list of lists. Run example(refpkgContents) for details.
返回一个列表。运行example(refpkgContents)详情。


作者（S）----------Author(s)----------



Noah Hoffman




参考文献----------References----------

in the project repository in github: https://github.com/fhcrc/taxtastic
python package <code>taxonomy</code>, also available from the taxtastic project site.

参见----------See Also----------

taxonomyFromRefpkg
taxonomyFromRefpkg


举例----------Examples----------


archive <- 'vaginal_16s.refpkg.tar.bz2'
destdir <- tempdir()
system(gettextf('tar -xjf %s --directory="%s"',
                system.file('extdata',archive,package='clstutils'),
                destdir))
refpkg <- file.path(destdir, sub('.tar.bz2','',archive))
contents <- refpkgContents(refpkg)
str(refpkg)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。