R语言 clstutils包 findOutliers()函数中文帮助文档(中英文对照)

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findOutliers(clstutils)
findOutliers()所属R语言包：clstutils

                                         Identify outlier objects given a square distance matrix.
                                         距离平方矩阵识别离群对象。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Outliers are defined as elements with edge length to the centermost element > cutoff. The distance threshold (cutoff) can be either specified, or calculated as a quantile of all pairwise distances in the matrix.
离群点被定义为边长的最中心的元素>截止元素。距离阈值（截止）可以是指定的，或作为位数计算矩阵中的所有成对距离。


用法----------Usage----------


findOutliers(mat, quant, cutoff)



参数----------Arguments----------

参数：mat
square matrix of distances
距离方阵


参数：quant
given all pairwise distances x, calculate distance threshold as quantile(x, quant).  Values closer to 0 are more stringent.
给所有的X成对距离，计算距离阈值的位数（X，定量）。更严格的值接近0。


参数：cutoff
an absolute cutoff overriding quant
一个绝对的截止覆盖QUANT


值----------Value----------

Returns a boolean vector corresponding to margin of mat; outliers have a value of TRUE.
返回一个布尔向量相应的保证金垫;离群拥有一个真正的价值。


作者（S）----------Author(s)----------



Noah Hoffman




举例----------Examples----------


library(ape)
data(seqs)
data(seqdat)
dmat <- ape::dist.dna(seqs[seqdat$tax_name == 'Enterococcus faecium',],
        pairwise.deletion=TRUE, as.matrix=TRUE, model='raw')
summary(dmat[lower.tri(dmat)])
outliers <- findOutliers(dmat, cutoff=0.015)
table(outliers)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。