R语言 clippda包 phenoDataFrame()函数中文帮助文档(中英文对照)

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phenoDataFrame(clippda)
phenoDataFrame()所属R语言包：clippda

                                         A generic function to set classes for the variables in the dataframe of phenotypic information.
                                         一个通用的函数来设置dataframe表型信息的变量的类。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to set classes (e.g. as numeric or factor) to the variables in the dataframe.
一个函数来设置类（如数字或因素）在dataframe变量。


用法----------Usage----------


phenoDataFrame(PhenoData, variableClass)



参数----------Arguments----------

参数：PhenoData
is the dataframe of phenotypic information extracted from an object of class  aclinicalProteomicsData.  
是object类aclinicalProteomicsData提取的表型信息dataframe。


参数：variableClass
a character vector of length equal to the number of columns of the dataframe of phenotypic information, giving classes of the variables studied.  
特征向量的长度等于dataframe表型信息的列数，给类变量的影响。


值----------Value----------

A dataframe of class-corrected phenotypic variables.
一类修正的表型变量dataframe。


作者（S）----------Author(s)----------



Stephen Nyangoma




举例----------Examples----------


data(liverdata)

data(liver_pheno)

OBJECT=new("aclinicalProteomicsData")

OBJECT@rawSELDIdata=as.matrix(liverdata)
OBJECT@covariates=c("tumor" ,    "sex")
OBJECT@phenotypicData=as.matrix(liver_pheno)
OBJECT@variableClass=c('numeric','factor','factor')
OBJECT@no.peaks=53

Data=OBJECT
variableClass =Data@variableClass

variables = c("SampleTag","tumor","sex")

PhenoInfo <- data.frame(Data@phenotypicData)

PhenoData <- data.frame(Data@phenotypicData)

pData=phenoDataFrame(PhenoData, variableClass)

class(pData$sex)
class(pData$SampleTag)
class(pData$tumor)

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