R语言 zipfR包 read.spc()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.spc(zipfR)
read.spc()所属R语言包：zipfR

                                        Loading and Saving Frequency Spectra (zipfR)
                                         加载和保存频率谱（zipfR）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

read.spc loads frequency spectrum from .spc file
read.spc.spc文件加载频谱

write.spc saves frequency spectrum object in .spc file
write.spc节省频谱.spc文件中的对象


用法----------Usage----------



  read.spc(file)

  write.spc(spc, file)




参数----------Arguments----------

参数：file
character string specifying the pathname of a disk file. Files with extension .gz will automatically be compressed/decompressed. See section "Format" for a description of the required file format
字符串指定的磁盘文件的路径名。文件与扩展.gz将自动压缩/解压缩。为所需的文件格式的描述，请参见“格式”


参数：spc
a frequency spectrum, i.e.\ an object of class spc
的频谱，即\类的一个对象spc


格式----------Format----------

A TAB-delimited text file with column headers but no row names (suitable for reading with read.delim).  The file must contain at least the following two columns:
制表符分隔的文本文件，列标题，但没有行名称（适合阅读read.delim）。该文件必须至少包含以下两列：




m frequency class m
m频度等级m




Vm number V_m of types in frequency class
Vm数V_m类型的频度等级

An optional column labelled VVm can be used to specify variances of expected class sizes (for a frequency spectrum derived from a LNRE model or by binomial interpolation).  
一个可选的列标记VVm可以用来指定预期类大小（从一个LNRE的模型或二项式插值的衍生的频谱）的方差。

These columns may appear in any order in the text file.  All other columns will be silently ignored.
这些列中可能出现的任何命令的文本文件。所有其他列会被忽略。


Details

详细信息----------Details----------

If the filename file ends in the extension .gz, the disk file will automatically be decompressed (read.spc) and compressed (write.spc).
如果文件名file结束在延长.gz，磁盘文件会自动解压缩（read.spc）和压缩（write.spc）。

The .spc file format does not store the values of N, V and VV explicitly.  Therefore, incomplete frequency spectra and expected spectra with variances cannot be fully reconstructed from disk files.  Saving such frequency spectra (or loading a spectrum with variance data) will trigger corresponding warnings.
.spc文件格式不存储N，V和VV明确的值。因此，不完整的频谱和预期的差异光谱与不能被完全重建从磁盘文件。保存，这种频谱（或方差数据加载频谱），将触发相应的警告。


值----------Value----------

read.spc returns an object of class spc (see the spc manpage for details)
read.spc返回一个对象类spc（spc联机帮助的详细信息）


参见----------See Also----------

See the spc manpage for details on spc objects. See read.tfl and read.vgc for import/export of other data structures.
spc对象的详细信息，请参阅“spc的联机帮助页。见read.tfl和read.vgc的其他数据结构的导入/导出的。


实例----------Examples----------



## Not run: [＃不运行：]

## examples will not be run during package compilation[＃示例将不会运行在包编译]
## since they would require accessing and writing to[＃，因为他们需要访问和写入]
## external files[＃外部文件]

## load Italian ultra- data[＃加载意大利的超数据]
## and write corresponding spectrum to external text file[＃和外部文本文件中写入相应的频谱]
data(ItaUltra.spc)
write.spc(ItaUltra.spc,"ultra.spc")
## now ultra.spc is a text file with columns m and Vm[现在ultra.spc是一个文本文件，列m和Vm]

## we ready it back in[＃我们准备回]
New.spc <- read.spc("ultra.spc")

## same spectrum as ItaUltra.spc, compare:[＃相同的频谱为ItaUltra.spc，比较：]
summary(New.spc)
summary(ItaUltra.spc)

## DON'T do the following, incomplete spectrum will not be[＃不要做以下的，不完整的频谱将不会]
## restored properly!!![＃正确还原！]
zm &lt;- lnre("zm",ItaUltra.spc) # estimate model[估计模型]
zm.spc &lt;- lnre.spc(zm,N(zm)) # incomplete spectrum from model[不完整的光谱模型]
write.spc(zm.spc,"var.spc") # warnings[警告]
bad.spc <- read.spc("/Users/baroni/Desktop/var.spc")
## latter is DIFFERENT from zm.spc!!![后者是不同zm.spc的！]


## End(Not run)[＃（不执行）]


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