R语言 ChromHeatMap包 makeChrStrandData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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makeChrStrandData(ChromHeatMap)
makeChrStrandData()所属R语言包：ChromHeatMap

                                         Map a data matrix onto chromosome coordinates
                                         映射到染色体坐标数据矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given an ExpressionSet, or a data matrix with row names corresponding to the probe or gene IDs in an accompanying annotation package, this function returns a data structure that can be used with the plotChrMap function. This code is based on the Makesense method from the geneplotter package, extended to use both the CHRLOC and CHRLOCEND annotation environments from recent AnnotationDbi packages.
鉴于一个ExpressionSet，或数据矩阵与行名称对应的探针或基因标识，在随后的注解包，这个函数返回一个数据结构，可以使用plotChrMap函数。此代码的基础上扩展到使用从最近AnnotationDbi包，都CHRLOC和CHRLOCEND注释环境，从geneplotter包Makesense方法。

In principle, any AnnotationDbi-based package could be used to provide chromosome location data to this function; all that matters is that the probe or gene identifiers used by the annotation package should be from the same source as the data ExpressionSet featureNames or matrix row names.
在任何AnnotationDbi基于包的原则，可以用来提供此功能的染色体上的位置数据，所有重要的是，用探针或基因注释包标识符应该是从相同的源作为的的数据ExpressionSet featureNames或矩阵的行名。


用法----------Usage----------


makeChrStrandData(expr, lib)



参数----------Arguments----------

参数：expr
The ExpressionSet or data matrix to remap.
重新映射的ExpressionSet或数据矩阵。


参数：lib
The name of the annotation package to use.
注解包使用的名称。


值----------Value----------

A ChrStrandData object suitable for use with plotChrMap.
一个ChrStrandData对象适合与plotChrMap使用。


作者（S）----------Author(s)----------


Tim F Rayner



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>plotChrMap</code>, <code>ChrStrandData-class</code>

举例----------Examples----------


data('demo')
chrdata <- makeChrStrandData(exprs(ALLs.chr22), lib = "hgu95av2.db")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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