R语言 ChromHeatMap包 grabChrMapProbes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

grabChrMapProbes(ChromHeatMap)
grabChrMapProbes()所属R语言包：ChromHeatMap

                                         Identify the probes or genes plotted using plotChrMap
                                         确定探针或基因绘制使用plotChrMap

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Allows the user to interactively select regions of the plotChrMap heatmap, identifying all the probes or genes plotted in those regions.
允许用户以交互方式选择的plotChrMap热图的区域，确定所有的探针或基因绘制在这些区域。


用法----------Usage----------


grabChrMapProbes( plotmap )



参数----------Arguments----------

参数：plotmap
The output of the plotChrMap function.
plotChrMap函数的输出。


Details

详情----------Details----------

This function takes the output of the plotChrMap function and uses it to identify the probes or genes responsible for the signals plotted on the plotChrMap heatmap. It asks the user to select two points on either side of the heatmap bands of interest (specifically, boundary for inclusion of a given band is its left-hand edge), and returns a vector of probe/gene identifiers. This can be passed directly to AnnotationDbi::mget to yield gene symbols and other annotation.
此功能plotChrMap函数的输出，并用它来确定负责plotChrMap热图绘制信号的探针或基因。它要求用户选择两个点上的任何利益的热图带侧（具体地说，列入某一波段的边界是它的左边缘），并返回一个探针/基因标识的向量。这可以直接传递到AnnotationDbi :: MGET产生基因符号和其他注解。

Note that the plotting area layout() and par() values are not reset on exit, so that this function can be reused as many times as is desired.
请注意，绘图区布局（）和（PAR）值不重置退出，使这一功能，可以作为需要多次重复使用。


值----------Value----------

A character vector of probe/gene identifiers. If multiple identifiers have been averaged into a single band these identifiers will be string concatenated, separated by semicolons. The start, end and interval arguments to plotChrMap can be used in such cases to plot the data at a higher resolution, splitting such loci into separate bands.
探针/基因标识的一个特征向量。如果有多个标识符已经平均到一个单一的频段，这些标识符将字符串连接在一起，用分号隔开。起点，终点和时间间隔参数plotChrMap在这种情况下，可以用来绘制在更高的分辨率，分裂成独立乐队等位点的数据。


作者（S）----------Author(s)----------


Tim F Rayner



参见----------See Also----------

plotChrMap
plotChrMap


举例----------Examples----------


data('demo')
plotmap <- plotChrMap(chrdata, '22', cytoband='q11.23')
probes <- grabChrMapProbes(plotmap)
library('hgu95av2.db')
genes <- mget(probes, hgu95av2SYMBOL, ifnotfound=NA)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。