yaiVarImp(yaImpute)
yaiVarImp()所属R语言包:yaImpute
Reprots or plots importance scores for method randomForest
Reprots或图的重要性评分方法randomForest
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
When method randomforest is used to build a yai object, the randomForest package computes variable importance scores. This function computes a composite of the scores and scales them. By default the scores are plotted and scores themselves are invisibly returned.
randomforest包时的方法yai被用来建立一个randomForest对象,计算变量的重要性成绩。该函数计算的分数和尺度它们的复合物。默认情况下,绘制分数和分数本身是不可见的返回。
用法----------Usage----------
yaiVarImp(object, nTop=20, plot=TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
an object of class yai
一个对象的类yai
参数:nTop
the nTop most important variables are plotted (returned); if NA or zero, all are returned
“nTop最重要的变量绘制(); NA或为零时,都返回
参数:plot
if FALSE, no plotting is done, but the scores are returned.
如果为FALSE,没有绘制完成,但返回的分数。
参数:...
passed to boxplot function.
传递到盒形图的功能。
值----------Value----------
A data frame with the rows corresponding to the randomForest built for each Y-variable and the columns corresponding to the nTop most important Y-variables in sorted order.
一种数据框的行对应于变量和每个Y的列相对应的最重要的nTop的Y变量以排序的顺序建立randomForest。
(作者)----------Author(s)----------
Nicholas L. Crookston <a href="mailto:ncrookston.fs@gmail.com">ncrookston.fs@gmail.com</a> <br>
Andrew O. Finley <a href="mailto:finleya@msu.edu">finleya@msu.edu</a>
参见----------See Also----------
yai, yaiRFsummary, compare.yai
yai,yaiRFsummary,compare.yai
实例----------Examples----------
data(MoscowMtStJoe)
# get the basal area by species columns[断面积的物种列]
yba <- MoscowMtStJoe[,1:17]
ybaB <- whatsMax(yba,nbig=7) # see help on whatsMax[帮助whatsMax]
ba <- cbind(ybaB,TotalBA=MoscowMtStJoe[,18])
x <- MoscowMtStJoe[,37:64]
x <- x[,-(4:5)]
rf <- yai(x=x,y=ba,method="randomForest")
yaiVarImp(rf)
keep=colnames(yaiVarImp(rf,plot=FALSE,nTop=9))
newx <- x[,keep]
rf2 <- yai(x=newx,y=ba,method="randomForest")
yaiVarImp(rf2,col="gray")
compare.yai(rf,rf2)
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