R语言 xpose4data包 xpose.data()函数中文帮助文档(中英文对照)

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xpose.data(xpose4data)
xpose.data()所属R语言包：xpose4data

                                        Creates an Xpose data object
                                         创建一个XPOSE数据对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an xpose.data object.
创建xpose.data对象。


用法----------Usage----------


           xpose.data(runno,
                      tab.suffix="",
                      sim.suffix="sim",
                      cwres.suffix="",
                      directory="",
                      quiet=TRUE,
                      table.names=c("sdtab","mutab","patab","catab",
                        "cotab","mytab","extra","xptab","cwtab"),
                      cwres.name=c("cwtab"),
                      mod.prefix="run",
                      mod.suffix=".mod",
                      phi.suffix=".phi",
                      phi.file=NULL,
                      nm7=NULL,  
                      ...)



参数----------Arguments----------

参数：runno
Run number of the table files to read.  
运行数表文件阅读。


参数：tab.suffix
Suffix to be appended to the table file names for the "real" data.
被添加到“真实”数据表文件名称的后缀。


参数：sim.suffix
Suffix to be appended to the table file names for any simulated data.
被附加到任何模拟数据表文件名的后缀。


参数：cwres.suffix
Suffix to be appended to the table file names for any CWRES data.
后缀附加表文件名的任何CWRES数据。


参数：directory
Where the files are located.
的文件的位置。


参数：quiet
A logical value indicating if more diagnostic messages should be printed when running this function.
一个逻辑值，该值指示是否应印更多的诊断信息时运行此功能。


参数：table.names
Default text that Xpose looks for when searching for table files.
表文件时，默认的文本XPOSE寻找。


参数：cwres.name
default text that xpose looks for when searching for CWRES table files.
默认文本。，XPOSE会搜索的CWRES表文件时。


参数：mod.prefix
Start of model file name.
开始的模型文件名。


参数：mod.suffix
End of model file name.
模型文件名结束。


参数：phi.suffix
End of \.phi file name.
\。披文件名结束。


参数：phi.file
The name of the \.phi file. If not NULL then supercedes paste(mod.prefix,runno,phi.suffix,sep="").
\。披文件的名称。如果不是NULL paste(mod.prefix,runno,phi.suffix,sep="")取代。


参数：nm7
T/F if table files are for NONMEM 7/6, NULL for undefined.
T/F如果表文件是NONMEM 7/6，NULL为未定义的。


参数：...
Extra arguments passed to function.
额外的参数传递给函数。


Details

详细信息----------Details----------

Xpose expects, by default, to find the following NONMEM tables in the working directory to be able to create an Xpose data object (using a run number of 5 as an example):
XPOSE预期，默认情况下，找到下面的NONMEM表中的工作目录是能够建立一个XPOSE数据对象（使用运行5号作为一个例子）：

sdtab5: The 'standard' parameters, including IWRE, IPRE, TIME, and the  NONMEM default items (DV, PRED, RES and WRES) that are added when  NOAPPEND is not present in the \$TABLE record.
sdtab5：“标准”的参数，包括IWRE，IPRE，时间和NONMEM默认项（DV PRED，RES和WRES），，时添加的NOAPPEND在\ $表中的记录是不存在的。

\$TABLE ID TIME IPRE IWRE    NOPRINT ONEHEADER FILE=sdtab5
\$TABLE ID TIME IPRE IWRE    NOPRINT ONEHEADER FILE=sdtab5

patab5: The empirical Bayes estimates of individual model parameter values, or posthoc estimates. These are model parameters, such as CL, V2, ETA1, etc.
patab5的经验Bayes估计各个模型的参数值，或进行事后估计。这些模型的参数，如CL，V2，ETA1等

\$TABLE ID CL V2 KA K F1 ETA1 ETA2 ETA3   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=patab5
\$TABLE ID CL V2 KA K F1 ETA1 ETA2 ETA3   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=patab5

catab5: Categorical covariates, e.g. SEX, RACE.
catab5：分类协变量，例如性别，种族。

\$TABLE ID SEX HIV GRP   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=catab5
\$TABLE ID SEX HIV GRP   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=catab5

cotab5: Continuous covariates, e.g. WT, AGE.
cotab5：连续协变量，例如WT，年龄。

\$TABLE ID WT AGE BSA HT GGT HB   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=cotab5
\$TABLE ID WT AGE BSA HT GGT HB   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=cotab5

mutab5, mytab5, extra5, xptab5: Additional variables of any kind. These might be useful if there are more covariates than can be accommodated in the covariates tables, for example, or if you have other variables that should be added, e.g. CMAX, AUC.
mutab5，mytab5，extra5，xptab5其他任何形式的变量。这可能是有用的，如果有更多可容纳的协变量的在协变量表，例如，或者如果你有其他变量应该加入，例如： CMAX，AUC。

The default names for table files can be changed by changing the dafault values to the function.  The files that Xpose looks for by default are:
表文件的默认名称可以改变的功能改变dafault值。 ，XPOSE寻找的文件默认情况下是：


值----------Value----------

An xpose.data object.
xpose.data对象。


（作者）----------Author(s)----------


Niclas Jonsson, Andrew Hooker



参见----------See Also----------

xpose.data-class, Data, SData, read.nm.tables,
xpose.data-class，Data，SData，read.nm.tables，


实例----------Examples----------



## We expect to find the required NONMEM run and table files for run[＃我们希望找到所需的NONMEM运行和表文件运行的]
## 1 in the current working directory, using default Xpose format[排名第1的当前工作目录，使用默认XPOSE格式]
## Here we create files from an example NONMEM run[＃在这里我们创建的文件从一个例子NONMEM运行]
simprazExample(overwrite=FALSE)
xpdb <- xpose.data(1)

## Not run: [＃不运行：]
## We expect to find the required NONMEM run and table files for run[＃我们希望找到所需的NONMEM运行和表文件运行的]
## 5 in the current working directory, and that the table files have[在当前的工作目录，第5和表文件]
## a suffix of '.dat', e.g. sdtab5.dat[＃后缀“。DAT”，例如： sdtab5.dat]

xpdb5 <- xpose.data(5, tab.suffix = ".dat")

## End(Not run)[＃（不执行）]

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