R语言 ChIPsim包 writeFASTQ()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

writeFASTQ(ChIPsim)
writeFASTQ()所属R语言包：ChIPsim

                                         Write read sequences and qualities to a FASTQ formatted file
                                         写读序列和素质到FASTQ格式的文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is intended to produce the final output of the simulation by providing a fastq file that may  then be used in an analysis pipeline.
这是为了生产提供了fastq文件，然后可以在分析管道使用最终输出模拟。


用法----------Usage----------


writeFASTQ(read, quality, name, file, append = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：read
List of read sequences.  
读取序列名单。


参数：quality
List of read quality scores.  
列表只读质量分数。


参数：name
Read names.  
读的名字。


参数：file
File name. If this is “” results will be printed to the standard output connection.  
文件的名称。如果这是“结果将被打印到标准输出连接。


参数：append
Logical indicating the reads should be appended to an existing file.  
逻辑表示读取应追加到现有文件。


Details

详情----------Details----------

The first three arguments should have the same length but will be recycled if necessary.
前三个参数应该具有相同的长度，但如有必要将回收。


值----------Value----------

Called for its side effect.
呼吁其副作用。


作者（S）----------Author(s)----------



Peter Humburg




参见----------See Also----------

readSequence, readQualitySample, writeReads
readSequence，readQualitySample，writeReads


举例----------Examples----------


set.seed(1)

## generate sequence read and quality[＃生成序列读取和质量。]
quality <- paste(sample(unlist(strsplit(rawToChar(as.raw(33:126)),"")),
        36, replace = TRUE), collapse="")
read <- paste(sample(c("A", "C", "G", "T"), 36, replace = TRUE), collapse = "")

## write a fastq record[＃写fastq纪录。]
writeFASTQ(read, quality, "read_1", file="")

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