readSequence(ChIPsim)
readSequence()所属R语言包:ChIPsim
Convert read position into read sequence
转换读入读序列位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a read position, a reference sequence, a strand and a read length this function returns the read sequence.
鉴于一个只读的位置,参考序列,链只读这个函数返回的读序列的长度。
用法----------Usage----------
readSequence(readPos, sequence, strand, readLen = 36)
参数----------Arguments----------
参数:readPos
Numeric value indicating the start position on the chromosome.
数值表明在染色体上的起始位置。
参数:sequence
Chromosome sequence (a DNAString)
染色体序列(DNAString)
参数:strand
Strand indicator (+1 / -1)
股指标(+1 / -1)
参数:readLen
Length of read.
读取的长度。
值----------Value----------
Read sequence.
读序列。
作者(S)----------Author(s)----------
Peter Humburg
参见----------See Also----------
readError, writeReads
readError,writeReads
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注:
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