R语言 wombsoft包 Data()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Data(wombsoft)
Data()所属R语言包：wombsoft

                                        Data preparation
                                         数据准备

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a text file with coordinates and markers in columns and individuals in rows.
阅读一个文本文件中，列和行的个人坐标和标志。


用法----------Usage----------


DataCodominant(input_file,conversion,nb_x,nb_y,output_coords="coord_km.txt")



参数----------Arguments----------

参数：input_file
Path of the input text file. For dominant or codominant data, each row contains the name of the individual, the two coordinates (either abscissa and ordinates, or longitude and latitude), and the genetic data in succession. For contingency table, each row corresponds to a sampled point, with the name of the point, its coordinates, and the number of individuals for each modality of each variable.
输入文本文件的路径。对于显性或显性的数据，每行包含个人的名字，两个坐标（横坐标和纵坐标或经度和纬度），并在继承的遗传数据。对于列联表，每一行对应于一个采样点，与该点的名称，它的坐标，并为每个模态的每个变量的数目的个人。


参数：conversion
0 if the coordinates are cartesians, 1 if they are in degree and therefore need to be converted to cartesians.
0如果坐标笛卡尔，如果他们是在程度，因此需要将其转换到笛卡尔。


参数：nb_x,nb_y
number of pixels in width and length of the grid.
宽度和长度的网格中的像素数目。


参数：output_coords
the name of the file where the kilometer coordinates will be saved in. Default value is "coord\_indiv.txt".
一公里的坐标将被保存。默认值的文件的名称是“经纬度\ _indiv.txt”的。


值----------Value----------

a list of six items : <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>spatial coordinates of individuals</td> <td> a matrix with one line per individual, and two columns containing abscissa and ordinates of individuals, (x,y).</td></tr> <tr valign="top"><td>genetic_encoded</td> <td> the genetic data, containing one column per locus. If data are dominant, it's the same table as the input file.</td></tr> <tr valign="top"><td>grid</td> <td> a list of the vector of x, and the vector of y.</td></tr> <tr valign="top"><td>cvx_vertices</td> <td> the        vertices of the convex hull of sampling area (same format than individuals coordinates).</td></tr> <tr valign="top"><td>cvx_matrix</td> <td> a matrix containing a 1 if the corresponding point of the grid is in the convex hull, and a 0 otherwise.</td></tr> <tr valign="top"><td>nb_individual</td> <td> the number of individuals in the dataset.</td></tr>   </table>
列表中的六个项目：<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> spatial coordinates of individuals</ TD> <TD>矩阵每行一个个人，两列个人的横坐标和纵坐标（X，Y）</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>genetic_encoded </ TD> <TD>的遗传数据，包含一列每个位点。如果数据是显性的，这是同样的表作为输入文件。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>grid </ TD> <td>一个列表的向量x，而向量的y。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> cvx_vertices </ TD> <TD>的取样面积的凸包顶点（不是个人的坐标相同的格式）。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> cvx_matrix </ TD> <td>一个矩阵包含1，如果相应的点发车在凸包，和一个，否则为0。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>nb_individual </ TD> <TD>个人数据集的数量。 </ TD> </ TR> </ TABLE>

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注：
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