R语言 chipseq包 islandDepthPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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islandDepthPlot(chipseq)
islandDepthPlot()所属R语言包：chipseq

                                         Plot island depth distribution
                                         图岛深度分销

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the distribution of island depths using points for the observed islands and a line for the Poisson estimate of the noise. Useful for choosing a depth corresponding to a desired FDR.
图岛屿所观察到的岛屿和噪声的泊松估计点深度的分布。选择相应的深度所需的FDR非常有用。


用法----------Usage----------


islandDepthPlot(x, maxDepth = 20L)



参数----------Arguments----------

参数：x
A coverage object, e.g., RleList.  
覆盖对象，例如，RleList。


参数：maxDepth
The maximum depth to plot (there are usually some outliers).  
图的最大深度（通常有一些离群值）。


作者（S）----------Author(s)----------



D. Sarkar, M. Lawrence




参见----------See Also----------

peakCutoff for calculating a cutoff value for an FDR.
peakCutoff计算截止为FDR价值。


举例----------Examples----------


data(cstest)
cov <- coverage(resize(cstest$ctcf, width=200))
islandDepthPlot(cov)

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