R语言 chipseq包 cstest()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

cstest(chipseq)
cstest()所属R语言包：chipseq

                                         A test ChIP-Seq dataset
                                         测试芯片SEQ集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A small subset of a ChIP-Seq dataset downloaded from the Short-Read Archive.
从短期读取归档下载一个一个SEQ芯片集的一小部分。


用法----------Usage----------


data(cstest)



格式----------Format----------

The dataset is on object of class GenomeDataList with data from three chromosomes in two lanes representing CTCF and GFP pull-down in mouse.
数据集类的对象是GenomeDataList从三个代表CTCF和GFP的下拉在小鼠染色体在两个车道的数据。

The per-chromosome data is represented as a list of positive and negative strand alignment locations.  The recorded locations represent the aligned position at the first cycle.
作为一个正面和负面链对准位置列表中的每个染色体的数据表示。录制的地点在第一周期相一致的立场。


源----------Source----------

Short Read Archive, GEO accession number GSM288351 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSM288351
短读存档，GEO登录号GSM288351 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSM288351


参考文献----------References----------

Y.L., Zhang W., Jiang J., Loh Y.H., Yeo H.C., Yeo Z.X., Narang V., Govindarajan K.R., Leong B., Shahab A.S., Ruan Y., Bourque G., Sung W.K., Clarke N.D., Wei C.L., Ng H.H. (2008), “Integration of External Signaling Pathways with the Core Transcriptional Network in Embryonic Stem Cells”. Cell, 133:1106-1117.

举例----------Examples----------


data(cstest)
names(cstest)
cstest$gfp

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注：
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