R语言 ChIPseqR包 pos2gff()函数中文帮助文档(中英文对照)

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pos2gff(ChIPseqR)
pos2gff()所属R语言包：ChIPseqR

                                        Convert genome coordinates into GFF format
                                         GFF格式转换成基因组坐标

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Provides facility to export the location of genomic features to a GFF formatted file.
提供设施GFF格式的文件导出的基因组功能的位置。


用法----------Usage----------


pos2gff(pos, method, feature, len, strand, score, name)



参数----------Arguments----------

参数：pos
Named list with one component per chromosome giving the start position of features on that chromosome.
命名与每个染色体的一个组成部分的功能，染色体上的起始位置的列表。


参数：method
Entry for method field in GFF file. Recycled as necessary
方法领域GFF文件中的条目。回收作为必要


参数：feature
Entry for feature field in GFF file. Recycled as necessary
GFF文件功能领域的条目。回收作为必要


参数：len
Length of fetures. This is used to calculate matching end positions for each start position given in pos
长度的叉状。这是用来计算起始位置pos给每个匹配的结束位置


参数：strand
Entry for feature field in GFF file. Recycled as necessary
GFF文件功能领域的条目。回收作为必要


参数：score
Entry for feature field in GFF file. Recycled as necessary
GFF文件功能领域的条目。回收作为必要


参数：name
Entry for feature field in GFF file. Recycled as necessary
GFF文件功能领域的条目。回收作为必要


值----------Value----------

A data.frame with columns 'chromosome', 'method', 'feature', 'start',  'end', 'score', 'strand'. Writing this data frame to a text  file produces a GFF formatted file.  
一个data.frame列'chromosome'，'method'，'feature'，'start'，'end'，'score'，'strand'。这个数据框写入到一个文本文件，产生一个GFF格式化文件。


作者（S）----------Author(s)----------


Peter Humburg



参考文献----------References----------

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。