R语言 ChIPseqR包 plot,ReadCounts,missing-method()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot,ReadCounts,missing-method(ChIPseqR)
plot,ReadCounts,missing-method()所属R语言包：ChIPseqR

                                         Diagnostic Plots for Read Counts
                                         读计数的诊断图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Produces plots to assess the distribution of reads, either for an entire chromosome or within a (small) window.
生产图来评估分布，无论是对整个染色体或（小）窗口内读取。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'ReadCounts,missing'
plot(x, chr, center, score, width=2000, type=c("hilbert", "window"), ...)
## S4 method for signature 'RLEReadCounts,missing'
plot(x, chr, center, score, width=2000, type=c("hilbert", "window"), ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
Object of class ReadCounts or RLEReadCounts.   
对象的类ReadCounts或RLEReadCounts。


参数：chr
Index or name of chromosome for which read counts should be plotted.  
应绘制指数或染色体的名称为读计数。


参数：center
For type "window", the center coordinate of the window to plot.   
类型窗口，协调中心的绘图窗口。


参数：score
For type "window", an object of type BindScore  (or BindScore) that should be used to include information about the score and predicted binding sites into the plot.  
为类型“窗口”，一个类型的对象BindScore（或BindScore），应使用包括比分信息，并预测到图的结合位点。


参数：width
For type "window", the width of the window.   
对于类型“窗口”，窗口的宽度。


参数：type
Character string indicating the type of plot that should be produced (see details).   
字符串，指示应产生的图类型（见详情）。


参数：...
Further arguments (see details).  
进一步的论点（见详情）。


Details

详情----------Details----------

Type "window" produces a plot that shows read counts as vertical bars. If score is not missing, it is used to plot the score and predicted binding sites (if any) as well.  Any additional arguments are passed on to .plotWindow.
类型窗口产生一个图，显示为竖线读取计数。 score如果不缺少，它是用来绘制的得分和预测结合位点（如有）以及。任何额外的参数被传递到.plotWindow。

Type "hilbert" produces a Hilbert curve plot of read counts for an entire chromosome. Additional arguments are passed on to  .plotReads.
类型希尔伯特产生希尔伯特曲线图的阅读整个染色体计数。额外的参数传递到.plotReads。


值----------Value----------

Called for its side effect.
呼吁其副作用。


作者（S）----------Author(s)----------



Peter Humburg




参见----------See Also----------

hilbertImage
hilbertImage

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注：
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