R语言 ChIPseqR包 pickPeak()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

pickPeak(ChIPseqR)
pickPeak()所属R语言包：ChIPseqR

                                        Identify peaks above a given threshold
                                         确定一个给定的阈值以上的山峰

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a vector of scores and a threshold, this function finds all peaks  that exceed the threshold.
由于分数和阈值向量，这个函数发现超过阈值的所有山峰。


用法----------Usage----------


pickPeak(score, threshold, offset = 0, sub = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：score
Numeric vector.
数字向量。


参数：threshold
All values in score below this value are ignored.
score低于此值的所有值将被忽略。


参数：offset
Offset to add to the determined peak locations.
抵消添加到确定的峰值位置。


参数：sub
Logical. If this is FALSE (the default) for each region that exceeds the threshold only the global maximum is returned. Otherwise local maxima are returned as well.
逻辑。如果这是FALSE各区域，超过阈值（默认）全球最大的返回。否则局部极值以及返回。


值----------Value----------

If sub = FALSE a numeric vector giving the location of all peaks. Otherwise a list with components
如果sub = FALSE数字向量，使所有峰的位置。否则的组件列表


参数：peaks
The same peak locations that are returned for sub = FALSE.
返回sub = FALSE相同的峰值位置。


参数：subPeaks
A list with one component for each entry in "peaks" giving the location of local maxima.  
给予局部极大值的位置在“峰”的每个项目的一个组成部分名单。


注意----------Note----------

This function is used by callBindingSites for peak-calling.
此功能用于由callBindingSites峰检测。


作者（S）----------Author(s)----------


Peter Humburg



参见----------See Also----------

callBindingSites, startScore, getCutoff
callBindingSites，startScore，getCutoff

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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