R语言 WGCNA包 verboseScatterplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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verboseScatterplot(WGCNA)
verboseScatterplot()所属R语言包：WGCNA

                                         Scatterplot annotated by regression line and p-value
                                         散点图注明的回归线和p值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Produce a scatterplot annotated by the correlation, p-value, and regression line.
产品注明的相关性，p值和回归线的散点图。


用法----------Usage----------


verboseScatterplot(x, y,
                   sample = NULL,
                   corFnc = "cor", corOptions = "use = 'p'",
                   main = "", xlab = NA, ylab = NA,
                   cex = 1, cex.axis = 1.5, cex.lab = 1.5, cex.main = 1.5,
                   abline = FALSE, abline.color = 1, abline.lty = 1,
                   corLabel = corFnc, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
  numerical vector to be plotted along the x axis.  
数值向量要绘制的沿x轴。


参数：y
  numerical vector to be plotted along the y axis.  
数值向量要绘制沿y轴。


参数：sample
determines whether x and y should be sampled for plotting, useful  to keep the plot manageable when x and y are large vectors. The default NULL value implies no sampling. A single numeric value will be interpreted as the number of points to sample randomly. If a vector is given, it will be interpreted as the indices of the entries in x and y that should be plotted. In either case, the correlation and p value will be determined from the full vectors x and y.
决定是否x和y应该被采样的图，保持管理的图，当x和y大向量。默认NULL值并不意味着采样。随机采样点的数量将被解释为一个单一的数值。如果一个向量，它会被解释为指标x和y应该绘制中的条目。在任一情况下，将被确定的相关性和p值从充分向量x和y。


参数：corFnc
character string giving the correlation function to annotate the plot.  
字符串的相关函数进行注释的图。


参数：corOptions
character string giving further options to the correlation function.  
字符串提供进一步的相关函数的选项。


参数：main
main title for the plot.
主标题的图。


参数：xlab
label for the x-axis.  
标签的x轴。


参数：ylab
label for the y-axis.  
标签的y轴。


参数：cex
character expansion factor for plot annotations.  
图注释字符的膨胀系数。


参数：cex.axis
character expansion factor for axis annotations.  
轴注释字符的膨胀系数。


参数：cex.lab
character expansion factor for axis labels.  
字符膨胀系数轴标签。


参数：cex.main
character expansion factor for the main title.  
字符膨胀系数的主标题。


参数：abline
logical: should the linear regression fit line be plotted?  
逻辑：线性回归拟合线的绘制？


参数：abline.color
color specification for the fit line.
拟合线的颜色规范。


参数：abline.lty
line type for the fit line.
线类型的拟合线。


参数：corLabel
character string to be used as the label for the correlation value printed in the main title.  
字符串被用来作为印刷的相关值中的主标题的标签。


参数：...
other arguments to the function plot.  
其他参数功能plot。


Details

详细信息----------Details----------

Irrespective of the specified correlation function, the p-value is always calculated for pearson correlation.
无论指定的相关函数，p-值总是为Pearson相关计算。


值----------Value----------

If sample above is given, the indices of the plotted points are returned invisibly.
如果sample以上，散点的指数返回无形。


（作者）----------Author(s)----------


Steve Horvath and Peter Langfelder



参见----------See Also----------

plot.default for standard scatterplots
plot.default的为标准散点图

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