R语言 ChIPseqR包 getBindCor()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getBindCor(ChIPseqR)
getBindCor()所属R语言包：ChIPseqR

                                        Calculate cross-correlation between read counts
                                         计算读取计数之间的交叉相关

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates the cross-correlation between read counts on forward and reverse strand.
此函数计算的正向和反向链上的只读计数之间的交叉相关。


用法----------Usage----------


getBindCor(data, max.lag, summary, plot = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
An object of class ReadCounts
一个对象的类ReadCounts


参数：max.lag
Maximum lag to use in cross-correlation calculation.
最大滞后，使用互相关计算。


参数：summary
Function to use to summarise cross-correlation across chromosomes.
函数的使用总结整个染色体的交叉相关。


参数：plot
Logical indicating whether to plot cross-correlation.
逻辑表明是否要绘制交叉相关。


参数：...
Further arguments, currently ignored.
进一步的论据，目前被忽略。


Details

详情----------Details----------

Function fttcor in package “timsac” is used to carry out the computation.
功能fttcor包“timsac”的被用来进行计算。


值----------Value----------

The (summarised) cross-correlation. If summary is missing a list of cross-correlations for each chromosome is returned.
（汇总）的互相关。如果summary缺少每个染色体的交叉相关性列表返回。


作者（S）----------Author(s)----------


Peter Humburg



参见----------See Also----------

fftcor, ReadCounts, getBindLen
fftcor，ReadCounts，getBindLen

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注：
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