scaleFreePlot(WGCNA)
scaleFreePlot()所属R语言包:WGCNA
Visual check of scale-free topology
无标度拓扑结构的可视化检查
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A simple visula check of scale-free network ropology.
一个简单的visula检查无尺度网络ropology。
用法----------Usage----------
scaleFreePlot(connectivity, nBreaks = 10, truncated = FALSE, removeFirst = FALSE, main = "", ...)
参数----------Arguments----------
参数:connectivity
vector containing network connectivities.
向量的网络连通性。
参数:nBreaks
number of breaks in the connectivity dendrogram.
数量的连接聚类分析的截断。
参数:truncated
logical: should a truncated exponential fit be calculated and plotted in addition to the linear one?
逻辑:应该截断指数拟合计算和绘制除了线性?
参数:removeFirst
logical: should the first bin be removed from the fit?
逻辑:从第一个bin适合吗?
参数:main
main title for the plot.
主标题的图。
参数:...
other graphical parameter to the plot function.
其他图形的plot函数的参数。
Details
详细信息----------Details----------
The function plots a log-log plot of a histogram of the given connectivities, and fits a linear model plus optionally a truncated exponential model. The R^2 of the fit can be considered an index of the scale freedom of the network topology.
函数绘制log-log图的直方图给定的connectivities,适合用线性模型加一个可选的截断指数模型。可以被认为是指数的规模的网络拓扑自由R^2拟合。
值----------Value----------
None.
无。
(作者)----------Author(s)----------
Steve Horvath
参考文献----------References----------
Analysis", Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology: Vol. 4: No. 1, Article 17
参见----------See Also----------
softConnectivity for connectivity calculation in weigheted networks.
softConnectivity用于连接计算在weigheted网络。
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