R语言 ChIPseqR包 exportBindSequence()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

exportBindSequence(ChIPseqR)
exportBindSequence()所属R语言包：ChIPseqR

                                         Export sequence of predicted binding sites
                                         出口序列结合位点预测

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extracts sequence of predicted binding sites from reference genome and exports them in FASTA format.
提取物序列预测的参考基因组结合位点和出口FASTA格式。


用法----------Usage----------


exportBindSequence(prediction, reference, bind, overlap = FALSE, file = "")



参数----------Arguments----------

参数：prediction
Object of class BindScore.  
对象类BindScore。


参数：reference
Reference genome sequence (as XStringSet object).   
参考基因组序列的（XStringSet对象）。


参数：bind
Length of binding site to assume for sequence extraction. This may be missing in which case the value is  derived from 'prediction'.  
承担序列萃取结合位点的长度。这可能会丢失，在这种情况下，该值从'prediction'派生。


参数：overlap
Logical indicating whether overlapping predictions should be allowed.  
逻辑表示重叠的预测是否应该被允许。


参数：file
Name of output file.  
输出文件的名称。


值----------Value----------

An XStringViews object containing the sequences. If a file name is provided this is returned invisibly.
XStringViews对象，其中包含序列。如果一个文件名，这是无形返回。


作者（S）----------Author(s)----------



Peter Humburg




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

XStringViews, XStringSet, BindScore
XStringViews，XStringSet，BindScore

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注：
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