R语言 WGCNA包 plotNetworkHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotNetworkHeatmap(WGCNA)
plotNetworkHeatmap()所属R语言包：WGCNA

                                         Network heatmap plot
                                         网络热图图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Network heatmap plot.
网络热图图。


用法----------Usage----------


plotNetworkHeatmap(
  datExpr,
  plotGenes,
  useTOM = TRUE,
  power = 6,
  networkType = "unsigned",
  main = "Heatmap of the network")



参数----------Arguments----------

参数：datExpr
a data frame containing expression data, with rows corresponding to samples and columns to genes. Missing values are allowed and will be ignored.  
含有一个数据框的行对应的样品和列的基因表达数据，。遗漏值是允许的，将被忽略。


参数：plotGenes
a character vector giving the names of genes to be included in the plot. The names will be matched against names(datExpr).  
字符向量给基因的名字被列入中的图。将匹配names(datExpr)的名称。


参数：useTOM
logical: should TOM be plotted (TRUE), or correlation-based adjacency (FALSE)?  
逻辑：TOM绘制（TRUE），或相关性为基础的邻接（FALSE）？


参数：power
soft-thresholding power for network construction.  
软阈值功率的网络建设。


参数：networkType
a character string giving the newtork type. Recognized values are (unique abbreviations of) "unsigned", "signed", and "signed hybrid".  
一个字符串给newtork类型。可识别的值是（唯一的缩写）"unsigned"，"signed"和"signed hybrid"。


参数：main
main title for the plot.  
主标题的图。


Details

详细信息----------Details----------

The function constructs a network from the given expression data (selected by plotGenes) using the soft-thresholding procedure, optionally calculates Topological Overlap (TOM) and plots a heatmap of the network.
从给定的表达式使用软阈值的数据（选择plotGenes）函数构造一个网络，可以计算的拓扑重叠（TOM）和绘制的网络热图。

Note that all network calculations are done in one block and may fail due to memory allocation issues for large numbers of genes.
请注意，所有的网络计算都是在一个块中，可能会失败，由于大量基因的内存分配问题。


值----------Value----------

None.
无。


（作者）----------Author(s)----------


Steve Horvath



参考文献----------References----------

Network Analysis", Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology: Vol. 4: No. 1, Article 17

参见----------See Also----------

adjacency, TOMsimilarity
adjacency，TOMsimilarity

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。