plotMEpairs(WGCNA)
plotMEpairs()所属R语言包:WGCNA
Pairwise scatterplots of eigengenes
成对散点图的特征基因
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function produces a matrix of plots containing pairwise scatterplots of given eigengenes, the distribution of their values and their pairwise correlations.
该函数生成一个包含给定的特征基因,他们的价值观,他们的两两相关性分布的成对散点图矩阵图。
用法----------Usage----------
plotMEpairs(
datME,
y = NULL,
main = "Relationship between module eigengenes",
clusterMEs = TRUE,
...)
参数----------Arguments----------
参数:datME
a data frame containing expression data, with rows corresponding to samples and columns to genes. Missing values are allowed and will be ignored.
含有一个数据框的行对应的样品和列的基因表达数据,。遗漏值是允许的,将被忽略。
参数:y
optional microarray sample trait vector. Will be treated as an additional eigengene.
可选的芯片样品的特征向量。将被视为作为额外的eigengene。
参数:main
main title for the plot.
主标题的图。
参数:clusterMEs
logical: should the module eigengenes be ordered by their dendrogram?
逻辑模块的特征基因,责令他们的树状图?
参数:...
additional graphical parameters to the function pairs
额外的图形参数的功能pairs
Details
详细信息----------Details----------
The function produces an NxN matrix of plots, where N is the number of eigengenes. In the upper traingle it plots pairwise scatterplots of module eigengenes (plus the trait y, if given). On the diagonal it plots histograms of sample values for each eigengene. Below the diagonal, it displays the pairwise correlations of the eigengenes.
该函数产生一个NxN矩阵的图,其中N是特征基因数目。在上面的黄金三角图两两模块特征基因(加的特征y,若有的话),散点图。对角线上的它图样品为每个eigengene值的直方图。下面的对角线,它会显示两两相关的特征基因。
值----------Value----------
None.
无。
(作者)----------Author(s)----------
Steve Horvath
参见----------See Also----------
pairs
pairs
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注:
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